שיתוף פעולה במסגרת האיחוד האירופי
משרד התשתיות הלאומיות רואה חשיבות רבה בשיתוף פעולה במסגרת תוכניות המו"פ של האיחוד האירופי. עקב כך פועל להגברת מודעות החוקרים להגשת הצעות מחקר בתחום האנרגיה לתוכניות המסגרת השונות של האיחוד, וכן לבניית שותפויות שיכללו מוסדות אקדמיים וחברות תעשייתיות מישראל.
שיתוף פעולה עם גרמניה
המשרד מעורב באופן פעיל בשיתוף פעולה מדעי-טכנולוגי בתחום האנרגיה עם ממשלת גרמניה, המבוצע במסגרת הסכם בין משרד המדע, התרבות והספורט הישראלי לבין משרד החינוך והמדע הגרמני. מחקרים במוסדות מחקר ישראליים, בשיתוף חוקרים מגרמניה, ממומנים על-ידי ממשלת גרמניה בהיקף של כ-400,000 אירו בשנה.
למשרד התשתיות הלאומיות נציג בוועדה המשותפת לשתי המדינות, הבוחרת פעם בשנה את פרוייקטי המחקר המשותפים. מאז התחיל שיתוף פעולה זה ב-1976, נתמכו מחקרים במגוון רחב של נושאים, שכללו שריפת פחם, ניצול אנרגיית השמש ושימוש יעיל באנרגיה בבניינים.
שיתוף פעולה עם איטליה
המשרד חתום (בשם ממשלת ישראל) על הסכם להפעלת תוכנית לשיתוף פעולה בתחום המחקר באנרגיה עם ממשלת איטליה. התחומים המצויינים בהסכם הם אנרגיית השמש (תרמית ופוטוולטאית), אדריכלות ביו-אקלימית, אנרגיה בחקלאות וטכנולוגיות התפלה.
עד כה בוצעו שני מחקרים במסגרת ההסכם, אחד באוניברסיטת תל אביב (בתחום אגירת אנרגיה חשמלית) ואחד בבית הספר הגבוה לטכנולוגיה (בתחום תאי השמש).